Создатели известнейшей в 2138 году игры "Иггдрасиль", столь сильно полюбившейся игрокам, представляющей собой волшебный мир с множеством возможностей, вынуждены объявить о закрытии. Несмотря на то, что в скором времени все серверы игры будут отключены и все игроки уже покинули игру, Момонга, главный герой истории, не хочет расставаться с игрой, и решает остаться. Однако, к его удивлению, подключение к игре не было прервано принудительно, и герой остался в Иггдрасиле, превратившись в Темного Повелителя. Отныне в распоряжении героя находится Великая Гробница Назарик, а сам он стал великим волшебником-скелетом. Помимо этого в привычной и уже знакомой ему игре происходят и иные удивительные события: мир расширяется, NPC вопреки своему назначению начинают испытывать эмоции, а сам герой начинает ощущать запахи.
Смирившись с тем, что ему придется остаться в волшебном мире игры без возможности вернуться в реальность к родным и близким, Момонга всеми силами пытается обнаружить подобных ему людей из реального мира, запертых в игре, для чего берет новое имя - Айнц Ул Гоун, в честь гильдии, главой которой он был совсем недавно, и всеми силами пытается сделать так, чтобы его имя было на слуху среди обитателей Иггдрасиля. Однако не всё так хорошо, как может показаться: далеко не все жители Иггдрасиля настроены по отношению к герою доброжелательно. Назревает война с королевством. Предстоящие испытания не пугают героя, но какими же событиями они обернутся.
